軟下疳不經治療的自然病程可持續數月，小的病損可在2-4周內愈合。由于出現了對磺胺和四環素，氯霉毒等耐藥菌株，使軟下疳的治療有些困難。

　　一、全身治療

　　(1)紅霉素，利君沙，羅紅霉素，阿齊霉素;

　　(2)頭孢曲松鈉，治菌必妥，樂施福定，特滅菌;

　　二、局部治療

　　(1)未破潰的丘疹或結節，外用魚石脂，紅霉素軟膏。

　　(2)潰瘍，用1/5000高錳酸鉀或雙氧水沖洗，然后，外用紅霉素軟膏，因軟下疳

　　易于自身接種，應做好局部清潔消毒。

　　(3)淋巴膿腫;穿刺應在遠處正常皮膚刺入膿腔，抽吸膿液。

　　三、合并HIV感染的處理

　　這類患者有潰瘍愈合更慢，療程要更長，短程治療往往失敗，應用兩種以上抗生素聯合用藥。有條件時應從病灶中分離杜克雷嗜血桿菌作抗生素敏感試驗。

　　治療3-7天后，應對患者進行再次檢查，若治療有效，3日內潰瘍癥狀即有改善，7日內潰瘍即可見明顯愈合。否則，應考慮：診斷是否正確，是否同時合并另一種STDs病原體感染;是否同時有HIV感染;或杜克雷嗜血桿菌是否對抗生素耐藥。通常，潰瘍愈合的時間和潰瘍大小有關，較大的潰瘍可能需要兩周才能愈合。